Εδώ και χρόνια ακούγεται από όλες τις πλευρές έντονη κριτική κατά της ΕΑΑΣ, αναφερόμενη κυρίως στη μη ικανοποίηση από τον τρόπο εκπροσώπησης των συμφερόντων των μελών της. Κατά τους τελευταίους μήνες η κριτική αυτή έγινε εντονότερη και πλέον επιθετική, εξαιτίας των προβλημάτων που δημιούργησε η κυβερνητική πολιτική στα εισοδήματα τόσο των αποστράτων όσο και των εν ενεργεία στρατιωτικών, με αποκορύφωμα το μεγάλο πρόβλημα του ΜΤΣ.